BLAST中的E值是什么意思

2024-05-13

1. BLAST中的E值是什么意思

一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?
S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。
E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于这条显示的序列的可能性。所以它的分值越低越好。
E值的计算:
E=Kmn(e-lambda*S)

BLAST中的E值是什么意思