BLAST是用来干什么的?

2024-05-13

1. BLAST是用来干什么的?

BLAST包含五 个程序和若干个相应的数据库,分别针对不同的查询序列和要搜索的数据库类型。其中翻译的核酸库指搜索比对时会把核酸数据按密码子按所有可能的阅读框架转换成蛋白质序列。
BLAST对序列格式的要求是常见的FASTA格式。FASTA 格式第一行是描述行,第一个字符必须是“>”字符;随后的行是序列本身,一般每行序列不要超过80个字符,回车符不会影响程序对序列连续性的看法。 序列由标准的IUB/IUPAC氨基酸和核酸代码代表;小写字符会全部转换成大写;单个“-”号代表不明长度的空位;在氨基酸序列里允许出现“U”和 “*”号;任何数字都应该被去掉或换成字母(如,不明核酸用“N”,不明氨基酸用 “X”)。此外,对于核酸序列,除了A、C、G、T、U分别代表各种核酸之外,R代表G或A(嘌呤);Y代表T或C(嘧啶);K代表G或T(带酮基);M 代表A或C(带氨基);S代表G或C(强);W代表A或T(弱);B代表G、T或C;D代表G、A或T;H代表A、C或T;V代表G、C或A;N代表A、 G、C、T中任意一种。对于氨基酸序列,除了20种常见氨基酸的标准单字符标识之外,B代表Asp或Asn;U代表硒代半胱氨酸;Z代表Glu或Gln; X代表任意氨基酸;“*”代表翻译结束标志。
BLASTp:用蛋白质序列搜索蛋白质序列库
BLASTn:用核酸序列搜索核酸库
BLASTx:核酸序列对蛋白质库的比对,核酸序列在比对之前自动按照六个读码框翻译成蛋白质序列
tBLASTn:蛋白质序列对核酸库的比对,核酸库中的序列按照六个读码框翻译后与蛋白质序列进行比对搜索
tBLASTx:核酸序列对核酸库在蛋白质质级别的比对,两者都在搜索之前翻译成为蛋白质质进行比对

BLAST是用来干什么的?

2. blast是什么意思

  blast英 [blɑ:st] 美 [blæst]

  n.爆炸; 一阵(疾风等) (吹奏乐器、哨子、汽车喇叭等突然发出的) 响声; 突如其来的强劲气流;

  vt.击毁,摧毁; 尖响; 裁判高声吹哨; 枯萎:使枯萎;

  vi.爆炸; 吼叫; 枯萎:枯萎; 攻击:严厉批评或猛烈攻击;

  [例句]The blast caused extensive damage to the house.

  爆炸给这所房子造成了大面积的损坏。

  [其他]第三人称单数:blasts 复数:blasts 现在分词:blasting 过去式:blasted 过去分词:blasted

3. blast与blat有什么区别

区别在于意思不同。
blast意思是爆炸;一阵(疾风等)。
blat意思是(小牛或小羊)叫,喋喋不休,不加思索说出。

例句:
blast
1、250 people were killed in the blast. 
250人在这次爆炸中丧生。
2、There is a risk that toxic chemicals might be blasted into the atmosphere. 

爆炸后有毒化学物质可能会进入大气层。
3、Their work was taken up with boring and blasting rock with gelignite. 

他们的工作是用葛里炸药炸石头,非常枯燥。

blat
1、I could see Sanggat making his way to the blat, with tear-filled eyes he approachedand in between sobs he asked, Sir, are you coming back? 
我看见桑戈特泪流满面地向船走来,他呜咽着问我:老师,您还回来吗?
2、My father sneezed, his father's father before him were all men for whom a blat from the nose was every bit as bracing as a plunge into the snow following asauna. 

这些人鼻子都是哇哧哇哧的,每每都好像大雪天洗蒸汽浴之后一种冰冷的感觉。

blast与blat有什么区别

4. blast是什么意思

blast英
[blɑ:st]
美
[blæst]
  n.爆炸;
一阵(疾风等)
(吹奏乐器、哨子、汽车喇叭等突然发出的)
响声;
突如其来的强劲气流;
  vt.击毁,摧毁;
尖响;
裁判高声吹哨;
枯萎:使枯萎;
  vi.爆炸;
吼叫;
枯萎:枯萎;
攻击:严厉批评或猛烈攻击;
  [例句]The
blast
caused
extensive
damage
to
the
house.
  爆炸给这所房子造成了大面积的损坏。
  [其他]第三人称单数:blasts
复数:blasts
现在分词:blasting
过去式:blasted
过去分词:blasted

5. blasting是什么意思及用法

blasting    是英语单词
读音以及词义:
英['blɑ:stɪŋ]    美['blɑ:stɪŋ]    
n.    爆破(作业);    
v.    (用炸药) 炸毁( blast的现在分词 ); 狠打; 发出刺耳的高音; 向…猛吹,(用水)向…喷射;    
例句:
Their work was taken up with boring and blasting rock with gelignite
他们的工作是用葛里炸药炸石头,非常枯燥。

blasting是什么意思及用法

6. blasting是什么意思及用法

blasting    英['blɑ:stɪŋ]    美['blɑ:stɪŋ]    
n.    爆破(作业);    
v.    (用炸药) 炸毁( blast的现在分词 ); 狠打; 发出刺耳的高音; 向…猛吹,(用水)向…喷射;    
[例句]Their work was taken up with boring and blasting rock with gelignite
他们的工作是用葛里炸药炸石头,非常枯燥。
[其他]    原型: blast
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